Detecção molecular de viroses em inhame cultivado no Recôncavo da Bahia

Autores/as

  • Danilo Pereira Costa Universidade Federal do Recôncavo da Bahia/Embrapa Mandioca e Fruticultura
  • Paulo Ernesto Meissner Filho Embrapa Mandioca e Fruticultura
  • Sebastião de Oliveira e Silva Capes/UFRB

Resumen

A cultura do inhame (Dioscorea rotundata) pode ser infectada por algumas viroses. O objetivo deste trabalho foi diagnosticar as viroses presentes em inhame cultivado no Recôncavo da Bahia. Foram coletadas túberas de 40 plantas com e sem sintomas de viroses nos municípios de São Felipe, Maragojipe, São Félix e Cruz das Almas. Para a detecção do Badnavirus, o DNA total foi extraído, realizando-se, em seguida, as reações de RCA e PCR com primers degenerados. O RNA foi extraído das amostras e usado na reação de RT-PCR com primers específicos para o Yam mosaic virus (YMV) e Yam mild mosaic virus (YMMV). Para Badnavirus detectou-se uma banda de 580 pb. Na reação de RT-PCR obteve-se um fragmento de 586 pb com primers específicos para o YMV, sendo que o YMMV não foi detectado em nenhuma das amostras analisadas. Os fragmentos genômicos obtidos foram sequenciados e comparados com as sequências do GenBank, apresentando 87 a 99% de identidade com Badnavirus e 84 a 99% com as sequências disponíveis para isolados de YMV.

Descargas

Los datos de descargas todavía no están disponibles.

Citas

ANDRADE, G.P.; SILVA, A.K.S.; FILLOUX, D.; PIO-RIBEIRO, G.; KITAJIMA, E.W.; XAVIER, D.M. Plantas de Dioscorea alata infectada com YMMV no estado de Pernambuco.Fitopatologia Brasileira, v.31, p.344, 2006.

EDGAR, R.C. MUSCLE: A multiple sequence alignment method with reduced time and space complexity. BMC Bioinformatics, v.5, p.1-19, 2004.

ENI, A.O.; HUGHES J. D. A.; REY, M.E.C.; Survey of the incidence and distribution of five viruses infecting yams in the major yam-producing zones in Benin. Annals of Applied Biology, v.153, p.223–232, 2008.

FAO. FAOSTAT 2012. Disponível em: <http://faostat.fao.org/site/567/default.aspx#ancor.>Acessoem: 19 de Setembro. 2014.

FAUQUET, C.; MAYO, M.; MANILOFF, J.; DESSELBERGER, U.; BALL, L. (Eds) Virus taxonomy: Eighth Report of the International committee on Taxonomy of Viruses. Elsevier/ Academic Press, London, 2005, p.1269.

GAYRAL, P.; ISKRA-CARUANA, M. Phylogeny of Banana streak virus reveals recent and repetitive endogenization in the genome of its host (Musa sp.). Journal of Molecular Evolution, v.69, p.65-80, 2009.

GAMBINO, G.; PERRONE, I.; GRIBAUDO, I.A. Rapid and Effective Method for RNA Extraction from Different Tissues of Grapevine and Other Woody Plants, Phytochemical Analysis. v.19, p.520-525, 2008.

HARPER, G.; HART, D.; MOULT, S.; HULL, R.; GEERING, A.; THOMAS, J. The diversity of Banana streak virus isolates in Uganda. Archives of Virology, v.150, p.2407-2420, 2005.

IBGE. Base de dados de 2010. Produção de inhame. Disponível em:. Acesso em 23 Fevereiro. 2014.

ICTV. International Committe on Taxonomy of viruses. Taxonomy of family Caulimovilidae and Potyviridae. Disponível em_ <http://www.ictvoline.org/virusTaxonomy.asp?version=2012>. Acesso em: Setembro de 2014.

JAMES, A.P.; GEIJSKES, R.J.; DALE, J.L.; HARDING, R.M. Development of a Novel Rolling- Circle Amplification Technique to Detect Banana streak virus that also Discriminates Between Integrated and Episomal Virus Sequences. Plant Disease,v.95, p.57-62, 2011.

JOHNE, R.; MÜLLER, H.; RECTOR, A.; VAN,R.M.; STEVENS, H. Rolling-circle amplification of viral DNA genomesusing phi29 polymerase. Trends in Microbiology, v.17, p.205-211, 2009.

KAMAL SHARMA, K.; MISHRA, A.K.; MISRA, S.A simple and efficient method for extraction of genomic DNA from tropical tuber crops. African Journal of Biotechnology. v.7, p.1018-1022, 2008.

KENYON, L.; LEBAS, B.S.M.; SEAL, S.E. Yams (Dioscorea spp.) from the South Pacific Islands contain many novel badnaviruses: implications for international movement of yam germplasm. Archives of Virology, v.53, p.877-889, 2008.

LIMA, J.S.; LIMA, A.T.M.; CATILLO-URQUIZA, G.P.; SILVA, S.J.C.; ASSUNÇÃO, I.P.; MICHEREFF, S.J.; ZERBINI, M.; LIMA, G.S.A. Variabilidade genética de isolados de badnavírus infectando inhame (Dioscorea spp.) no nordeste do Brasil. Tropical Plant Patology, v.38, p.349-353, 2013.

MEDBERRY, S. L.; LOCKHART, B. E. L.; OLSZEWSKI, N. E. Properties of Commelina yellow mottle virus complete DNA sequence, genomic discontinuities and transcript suggest that it is a pararetrovirus. Nucleic Acids Research, v.18, p.5505-5513, 1990.

MOURA, R. M.; OLIVEIRA, I. S.; TORRES, G. R. C. Primeiro Assinalamento de Scutellonemabradys em Dioscorea alata no Brasil, Estabelecido no Estado de São Paulo. Fitopatologia Brasileira, v.31, p.211-211, 2006.

MUMFORD R.; SEAL S. Rapid Single-tube immunocapture RT-PCR for the detection of two yam of potyviruses. Jornal Virological Methods. v.69, p.73-79, 1997.

ODU, B. O.; ASIEDU, R.; SHOYINKA, S. A.; HUGHES, J. D. A. Screening of water yam (Dioscorea alata L.) genotypes for reactions to viruses in Nigéria. Journal of Phytopathology, v. 154, p. 716-724, 2006.

OLIVEIRA, I.S; LUZ, E.; BEZERRA, J.L.; MOUZA, R.M.; TORRES, G.R.C.; MAIA, L.C. Severidade da podridão-verde em inhames e especialização fisiológica de Penicillium sclerotigenum. Fitopatologia Brasileira, v.31, p.094-098, 2006.

SANTOS, E.S. Cultura do inhame (Dioscorea spp.). João Pessoa; EMEPA-PB, SEBRAE, 2002, 9p.

SILVA, J.A.; OLIVEIRA, A.P.; ALVES, G.S.; CAVALCANTE, L.F.; OLIVEIRA, A.N.P.; ARAÚJO, M.A.M. Rendimento do inhame adubado com esterco bovino e biofertilizante no solo e na folha. Revista Brasileira de Engenharia Agrícola e Ambiental, v.16, p.253-257, 2012.

TAMURA, K.; PETERSON, D.; PETERSON, N.; STECHER, G.; NEI, M.; KUMAR, S. MEGA5: Molecular Evolutionary Genetics Analysis using Maximum Likelihood, Evolutionary Distance, and Maximum Parsimony Methods. Molecular Biology and Evolution. v.28, p.2731-2739, 2011.

YANG, I.C.; HAFNER, G.J.; REVILL, P.A.; DALE, J.L.; HARDING, R.M. Sequence diversity of South Pacific isolates of Taro bacilloform virus and the development of a PCR-based diagnostic test. Archives of Virology, v.148, p.1957-1968, 2003.

Publicado

2017-05-12

Cómo citar

Costa, D. P., Meissner Filho, P. E., & Silva, S. de O. e. (2017). Detecção molecular de viroses em inhame cultivado no Recôncavo da Bahia. MAGISTRA, 28(1), 63–73. Recuperado a partir de https://periodicos.ufrb.edu.br/index.php/magistra/article/view/3694

Número

Sección

Artigo Científico