Otimização de protocolos para detecção molecular de viroses em inhame

Authors

  • Danilo Pereira Costa Universidade Federal do Recôncavo da Bahia/Embrapa Mandioca e Fruticultura
  • Emanuel Felipe Medeiros Abreu Embrapa Mandioca e Fruticultura
  • Paulo Ernesto Meissner Filho Embrapa Mandioca e Fruticultura
  • Sebastião de Oliveira e Silva Universidade Federal do Recôncavo da Bahia

Abstract

A presença de sintomas de viroses é frequente nos plantios de inhame do Nordeste e constitui-se um dos fatores limitantes de produção. Já foram relatados na cultura vírus dos gêneros Potyvirus, Badnavirus, Potexvirus, Maculavirus, Comovirus e Cucumovirus. Destacam-se pela importância e distribuição geográfica, espécies dos gêneros Potyvirus e Badnavirus. O objetivo deste trabalho foi otimizar e tornar reprodutível protocolos para a detecção molecular de espécies dos gêneros Potyvirus e Badnavirus em inhame. Foram coletadas túberas de 40 plantas com e sem sintomas de viroses nos municípios de São Felipe, Maragojipe, São Félix e Cruz das Almas. Para a detecção de Badnavirus  o DNA total foi extraído com base no protocolo de Kamal Sharma (2009) com modificações na quantidade de material vegetal processado, nas centrifugações, na concentração do DNA e na temperatura de anelamento na PCR. Enquanto para Potyvirus (Yam mosaic virus,YMV e Yam mild mosaic virus,YMMV), o RNA foi extraído testando as seguintes metodologias: Kit de Extração de RNA Total Axygen, Easyzol e protocolo de Gambino (2008), com modificações semelhantes às avaliadas no protocolo de extração de DNA. Para Badnavirus detectou-se uma banda de 580 pares de bases (pb). Na detecção de Potyvirus, obteve-se um fragmento de 586 pb com os primers para o YMV. O YMMV não foi detectado em nenhuma das amostras analisadas. Contudo, os protocolos que apresentaram melhores respostas para extração de DNA e RNA foram Kamal Sharma (2009) e Gambino (2008), respectivamente. Os fragmentos genômicos obtidos foram sequenciados, apresentando alta homologia com Badnavirus e YMV.

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Published

2017-06-06

How to Cite

Costa, D. P., Abreu, E. F. M., Meissner Filho, P. E., & Silva, S. de O. e. (2017). Otimização de protocolos para detecção molecular de viroses em inhame. MAGISTRA, 27(3/4), 442–451. Retrieved from https://periodicos.ufrb.edu.br/index.php/magistra/article/view/3695

Issue

Section

Comunicação Científica