Variabilidade de matrizes selecionadas de Passiflora quadrangularis L. com base em marcadores ISSR e RAPD
Resumo
Resumo: A quantificação da variabilidade genética existente entre matrizes selecionadas no programa de melhoramento genético do Passiflora quadrangularis é importante a cada ciclo de seleção recorrente. Neste trabalho, objetivou-se caracterizar e quantificar a variabilidade genética de 13 matrizes selecionadas de P. quadrangularis utilizando marcadores moleculares ISSR e RAPD. Um acesso de P. quadrangularis, um de P. alata e um híbrido interespecífico de P. alata x P. quadrangularis foram incluídos nas análises como outgroups. Para tanto, amostras de DNA genômico de cada genótipo foram extraídas, quantificadas por espectrofotometria e amplificadas utilizando-se primers para marcadores RAPD e ISSR. Os marcadores moleculares obtidos foram transformados em uma matriz de dados binários. Essa matriz foi utilizada para estimar as dissimilaridades genéticas entre os genótipos. O agrupamento foi obtido por meio de dendrograma, utilizando o método Unweighted Pair-Group Method using Arithmetic Avarages. A dispersão gráfica foi baseada em escalas multidimensionais, usando o método das coordenadas principais. Os marcadores RAPD e ISSR foram úteis para quantificar a variabilidade genética das matrizes selecionadas de P. quadrangularis, sendo que a PL6 e PL12 foram as que apresentaram maior dissimilaridade em relação às demais matrizes. Os marcadores RAPD e ISSR foram complementares na caracterização dos genótipos, sendo que os marcadores ISSR permitiram maiores estimativas de dissimilaridades e maior diferenciação desses genótipos.
Palavras chaves: Genética molecular, Passifloras silvestres, Seleção recorrente.
Downloads
Referências
Barbosa, A.C.O.F., et al. (2015). Range-wide genetic differentiation of Eugenia dysenterica (Myrtaceae) populations in Brazilian Cerrado. Biochemical Systematics and Ecology, 59, 288-296. DOI: https://doi.org/10.1016/j.bse.2015.02.004.
Bellon, G., et al. (2014). Variabilidade genética de genótipos elite de maracujazeiro, obtidos em programas de retrocruzamento envolvendo espécies silvestres e comerciais com base em marcadores RAPD. Bioscience Journal, 30 (6) 1692-1697.
Bellon, G., et al. (2009). Variabilidade genética de acessos obtidos de populações cultivadas e silvestres de maracujazeiro-doce com base em marcadores RAPD. Revista Brasileira Fruticultura, Jaboticabal, 31 (1), 197-202.
Camargo, N.G., Gontijo, O.J.S., & Barbosa, A.C.D.O.F. (2017). Caracterização de marcadores microssatélites em plantas nativas do Cerrado brasileiro. Multi-Science Journal, 1 (6), 41-47. DOI: http://dx.doi.org/10.33837/msj.v1i6.116
Castro, A.P.G., et al. (2011). Genetic variability of Passiflora spp. from comercial fields in the Federal District, Brazil. Ciência Rural, Santa Maria, 41 (6), 996-1002.
Cerqueira-silva, et al. (2012). Genetic variation in a wild population of the ‘sleep’ passion fruit (Passiflora setacea) based on molecular markers. Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, 11 (1) 731-738. Doi: 10.4238/2012.March.22.3.
Costa, J.N., et al. (2012). Effect of selection on genetic variability in yellow passion fruit. Crop Breeding and Applied Biotechnology, Viçosa, 12 (4), 253-260. DOI: https://doi.org/10.1590/S1984-70332012000400004
Cruz, C.D. (2013). GENES: a software package for analysis in experimental statistics and quantitative genetics. Acta Scientiarum Agronomy, 35 (3), 271-276. Doi: 10.4025/actasciagron.v35i3.21251
Faleiro, F.G., Andrade, S. R. M., & Reis Jr., F.B. (2011). Biotecnologia: estado da arte e aplicações na agropecuária (730 p). Planaltina: Embrapa Cerrados.
Faleiro, F.G., et al. (2003). Metodologia para operacionalizar a extração de DNA de espécies nativas do cerrado (Comunicado Técnico, n. 92). Planaltina: Embrapa Cerrados.
Faleiro, F.G., et al. (2015). Potencial de uso das plantas agrícolas nativas e de seus parentes silvestres. In: Veiga, R.F.A., & Queiróz, M.A. (Org.). Recursos fitogenéticos: a base da agricultura sustentável no Brasil. (v. 1, pp. 291-298). Viçosa: Ed. UFV.
Fonseca, K.G., et al. (2017). Morphoagronomic and molecular characterization of ornamental passion fruit cultivars. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, 52 (10), 849-860. Doi: https://doi.org/10.1590/s0100204x2017001000004
Martin, F.W., & Nakasone, H.Y. (1970). The edible species of Passiflora. Economic Botany, New York, 24 (3), 336-347.
Myburg, A.A., et al. (2014). The genome of Eucalyptus grandis. Nature, 5010 (7505), 356–362. Doi: 10.1038/nature13308. Epub 2014 Jun 11.
Nei, M., & Li, W.H.( 1979). Mathematical model for studying genetic variation in terms of restriction endonucleases. Proceedings of the National Academy Sciences of the USA, 76 (10), 5269-5273. Doi: 10.1073/pnas.76.10.5269
Oliveira, J.S., et al. (2019). Genetic variability of Passiflora spp. based on ISSR and RAPD. Asian Journal of Science and Technology, 10 (1), 9375-9378.
Sambroock, J., Fritsch, E.F., & Maniats, T. (1989). Molecular cloning: a laboratory manual. (2nd ed., 653 p). New York: Cold Spring Harbor.
Santos, L.F., et al. (2011). ISSR Markers as a Tool for the Assessment of Genetic Diversity in Passiflora. Biochemical Genetics, 49 (7-8), 540-554.
SAS Institute Inc. (2008). SAS user’s guide: statistic: version 9.1.3. (846 p). Cary: SAS Institute.
Sneath, P.H.A., & Sokal, R.R. (1973). Numerical taxonomy: the principles and practice of numerical classification, (573 p). San Francisco, W.H: Freeman and Company.
Sousa, A.G.R., et al. (2015). ISSR markers in wild species of Passiflora L. (Passifloraceae) as a tool for taxon selection in ornamental breeding. Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, 14 (4), 18534-18545. DOI http://dx.doi.org/10.4238/2015.December.23.41
Statsoft, Inc. (2007). Statistica for Windows: data analysis software system [Programa de computador] (version 7.1). Tulsa, Oklahoma: Statsoft.
Taheri, S., et al. (2018). Mining and development of novel SSR markers using next generation sequencing (NGS) data in plants. Molecules, 23 (2), 399. Doi: 10.3390/molecules23020399.
Downloads
Publicado
Como Citar
Edição
Seção
Licença
Autores que publicam nesta revista concordam com os seguintes termos:- Autores mantém os direitos autorais e concedem à revista o direito de primeira publicação, com o trabalho simultaneamente licenciado sob a Licença Creative Commons Attribution que permite o compartilhamento do trabalho com reconhecimento da autoria e publicação inicial nesta revista.
- Autores têm autorização para assumir contratos adicionais separadamente, para distribuição não-exclusiva da versão do trabalho publicada nesta revista (ex.: publicar em repositório institucional ou como capítulo de livro), com reconhecimento de autoria e publicação inicial nesta revista.